上海交通大学计算机科学与工程系成立于1984年。近三十年来，计算机系秉承交通大学“饮水思源，爱国荣校”的校训，坚持求实创新、面向需求、质量第一的宗旨，通过教学方法、教学内容、课程体系与管理体制的改革与创新，培养了一大批国家急需、社会满意的高素质人才。
近年来，随着计算机科学与技术在人们生活中的应用不断深入，特别是随着云计算、物联网、移动互联网、大数据等技术的兴起，交通大学计算机系不断调整学科方向，形成了高可靠软件与理论、并行与分布式系统、计算机网络、智能人机交互、密码学与信息安全等研究方向。遵循国际学术标准，计算机系正致力于在计算机学科领域力争成为世界一流的院系。
从2009年起计算机系已经开设本科和研究生的全英语教学课程，吸引外国留学生，同时使学院的学生具有国际视野，能在各个领域应用最新技术和计算机科学理论，并在将来成为各行业以及学术界的领军人物。学院也开设了一系列新的课程来应对IT知识的迅速更新以及企业的现实需求。
